· Os recursos agrícolas e florestais são insuficientes para as necessidades de uma população tão numerosa como a japonesa, apenas 14% das terras japonesas são próprias para o cultivo. Tal facto deve-se ao relevo montanhoso e à baixa fertilidade dos solos. A madeira, procedente das florestas de coníferas, é abundante, embora a localização de boa parte desses bosques em zonas montanhosas inacessíveis dificulte a sua exploração. A produção agrícola, tal como a exploração florestal e pesqueira, representam apenas uma pequena parte da produção nacional total. Os principais produtos agrícolas são a batata, o repolho, a beterraba, as frutas cítricas e o arroz (principal produto agrícola do país).
· Os recursos marítimos e pesqueiros, apesar da extensão de mar que circunda o país e dos inúmeros lagos que possui os seus recursos são insuficientes para servir toda a população, de modo que o Japão importa cerca de 10% do peixe que consome. A indústria pesqueira é importante pois o pescado faz parte dos hábitos alimentares dos japoneses. Anualmente são pescados em média cerca de 12 milhões de toneladas de peixe e moluscos, outros 1,5 milhões de toneladas são criados em viveiros.
· Os recursos minerais também são insuficientes para as necessidades do país. A qualidade dos minerais é fraca e os seus depósitos encontram-se muito dispersos, o que, somado ao escasso volume das reservas, impede a aplicação de métodos modernos de extracção em grande escala. Existem algumas jazidas de carvão, ferro, zinco, chumbo, prata, alumínio, cromita, manganês, calcário e enxofre. A extracção de carvão, principal recurso energético do país, concentra-se em Hokkaido e Kyushu. A escassa produção de petróleo é feita numa faixa que vai do norte de Honshu, no mar do Japão, às planícies de Ishikari-Yufutsu, em Hokkaido.
· Os recursos hidroeléctricos são abundantes, devido aos altos índices de pluviosidade e ao relevo abrupto. A rede fluvial, embora sofra frequentes inundações, é também utilizada para a irrigação. O maior potencial hidroeléctrico encontra-se na Honshu central, ao longo dos rios Shinano, Tenryu, Tone e Kiso e é intensamente aproveitado.
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